由浙江省人民政府与清华大学共同组建，旨在加强双方合作，充分发挥省校各自优势，探索社会主义市场经济条件下产学研结合的新途径、新形式，努力提高科技创新水平，加速科技成果产业化，加快科技人才培养，促进浙江省和长江三角洲地区的经济社会全面发展。
　　其宗旨是：以清华大学的技术、人才为依托，充分发挥和利用双方优势，面向国际竞争，面向浙江与长三角地区经济社会发展需求，在先进制造、信息技术、生物医药、生态环境保护、海洋资源开发等领域，设立重点实验室、工程研究中心和博士后流动站，建立国际技术转移中心和继续教育基地，努力将研究院建成国内一流的科技创新、人才培养和高新技术产业化基地，促进清华大学教育、科技事业和浙江省及长三角科技、经济与社会的全面发展。
　　研究院总部设在嘉兴科技城内，并分别设立嘉善院区和平湖院区。在杭州、北京建有办事机构。