中国科学技术大学上海研究院是中国科学技术大学在上海创办的一所新型研究院。以"追随智慧、崇尚创新"为理念，以"领导先进科技、培养顶尖人才"为宗旨，采取董事会领导下的院长负责制、首席科学家制以及走产学研一体化之路，实现体制创新和机制创新，力争在五年时间内成为亚洲一流的研究院，并成为中国高校教育体制改革的先行者。
中国科学技术大学上海研究院的定位是：
领先技术的研发和创新中心：学科设置着眼于前瞻、实用的前沿领域，吸引世界一流科学家，出原创性成果并形成该领域的领导地位。
顶尖人才的聚集和培养基地：结合中科大优秀的生源，面向市场需求，培养研究和应用人才，成为上海地区重要的人才基地。
产学研结合的科学园区：学科设置、人才输出和研发成果都面向上海及中国最具发展潜力的企业，学院与企业建立紧密的合作关系，成为上海地区重要的科学园区。